Technological Platforms - Gene Life Sciences -

Le séquençage standard est un service qui séquence les produits de PCR et l’ADN plasmidique demandé par les clients. Gene Life Sciences fournit des services plus rapides et plus précis basés sur le système d’automatisation de séquençage d’électrophorèse capillaire (CES) et une vaste expérience.

Une fois les résultats expédiés, les gestionnaires experts dans le domaine du séquençage sont prêts à apporter leur aide jusqu’au suivi.

Fonctionnalités

  • Système ABI
  • Résultats de haute qualité, longueur de lecture normale (1050 pb)
  • Un suivi en temps réel est possible de la réception de la commande à la livraison des résultats sur la base du système de gestion des informations de laboratoire (LIMS) (prochainement)
  • Service d’analyse de base gratuit fourni (recherche d’homologie à l’aide de BlastN et des ordres de séquence d’ADN)

 

Séquençage Standard

Séquençage standard simple / plaque

Le séquençage standard peut être effectué avec des tubes simples et des plaques 96 puits.

Séquençage à tube unique

  • Les échantillons sont préparés dans des tubes individuels sur demande

Séquençage des plaques 96well

  • Les échantillons sont préparés dans des plaques 96 puits sur demande
  • Jusqu’à 6 types d’apprêt peuvent être utilisés pour 1 plaque

Service additionnel

  • Purification du produit PCR (à la fois simple / plaque disponible)
  • Extraction de gel

Service NGS

Gene Life Sciences en collaboration avec plusieurs plateformes dans le monde propose une grande quantité d’informations sur le génome, fournit un service d’analyse du génome plus rapide et plus précis à un prix économique pour aider les études menées par des chercheurs et offre un service de diagnostic au public. Nous fournissons des services d’analyse du génome adaptés à la recherche, tels que le génome entier, l’exome, le transcriptome, l’épigénome et le métagénome, et les résultats de la bioinformatique basés sur les données. Offrant une solution génomique totale aux chercheurs au niveau national, basée sur notre vaste expérience et notre savoir-faire accumulé au fil des ans

 

Flux de travail

Applications Les technologies La bioinformatique
– Séquençage du génome entier
De novo / ReSeq)
– Séquençage de l’exome – Séquençage
ciblé
– Séquençage du transcriptome
(ARNm / micro ARN)
– Séquençage de l’épigénome
– Séquençage du métagénome
– HiSeq X Ten
– NovaSeq 6000
– HiSeq 2500 / HiSeq 4000
– NextSeq 500 / MiSeq
– PacBio RSII / PacBio Sequel
– Ion PGM
– Ion Proton
– 10x Chrome
– Bionano Saphyr
– Assemblage de novo
– Cartographie de référence
– Appel de variante (SNP / InDel)
– CNV & SV
– Expression génique
– Annotations fonctionnelles

 

Service d’identification moléculaire des espèces

ARNr 16S / 18S / 26S et séquençage complet de la région ITS

Le séquençage complet de l’ARNr 16S / 18S / 26S et de la région ITS est un service qui analyse les séquences en amplifiant les gènes d’ARN ribosomal de bactéries et de champignons (champignon filamenteux et levure) et en confirmant l’homologie des micro-organismes cibles à l’aide d’une base de données d’ARNr (NCBI).

Gene Life Sciences contrôle et exécute tous les processus, de l’extraction d’ADNg de bactéries et de champignons (champignons filamenteux et levures) à l’amplification par PCR, la purification, le séquençage et le rapport Bio-informatique.

Bactéries +

Pour les bactéries, la PCR des gènes de l’ARNr 16S est effectuée à l’aide des amorces 27F et 1492R, et le séquençage est effectué en utilisant les amorces 785F et 907R, qui sont les inter-amorces, pour identifier les bactéries. Si le client le demande, une amorce peut être sélectionnée / modifiée en plus et environ 1 350 pb ou des séquences plus longues peuvent être fournies

Champignons

Des résultats de 1600 pb ou plus sont garantis par le séquençage de la région de l’ARNr 18S. Des résultats de 500 pb ou plus sont garantis par le séquençage de la région ITS. Des résultats de 1 300 pb ou plus sont garantis par le séquençage du gène de l’ARNr 26S (région D1 / D2 / D3)

Identification des animaux / végétaux

L’identification animale / végétale est un service qui identifie une espèce d’organisme vivant en séquençant le « code-barres ADN », qui est une région utilisée pour l’identification d’espèces dans le gène d’un organisme vivant.

Si vous nous envoyez un échantillon, nous le traiterons de l’extraction de l’ADNg au résultat du séquençage de la zone de code-barres et fournirons le rapport d’analyse.

 

Fonctionnalités

  • Une espèce peut être distinguée par juste une petite partie d’un organisme vivant tel qu’une feuille d’une plante, un tissu d’un animal, une plume d’un oiseau ou une patte d’un insecte.
  • Un code-barres peut être identifié même pour les animaux difficiles à distinguer morphologiquement ou, quel que soit le stade de développement d’un organisme vivant car il contient toujours les mêmes informations.
  • L’identification peut être faite par comparaison avec les données existantes sur la biospécie à l’aide d’une technique de code à barres normalisée, et l’estimation de nouvelles espèces et l’identification d’espèces non enregistrées sont possibles.
  • Peut être utilisé pour l’identification des espèces de ressources biologiques, la vérification des ressources biologiques, la vérification des matières premières et la vérification de la contamination biologique.
  • Un service personnalisé est disponible pour certains gènes standards ou échantillons spécifiques.
Division Échantillon type Gènes à analyser Analyse supplémentaire
Codes à barres d’animaux Animal, insecte, oiseau, poisson, etc. COI ARNr 12S / 16S, ITS
Code à barres des plantes plante matK, rbcL rpoB, rpoC1, atpF-atpH, psbK-psbI. psbA-trnH

 

Service d’analyse MLST

Le typage de séquences multi-locus (MLST) est une méthode d’analyse utilisée pour classer les souches avec les mêmes espèces telles que les bactéries et les champignons. Le séquençage est effectué sur cinq à sept gènes de ménages spécifiques d’espèces pour analyser la corrélation de chaque ST (type de séquence) et les relations évolutives génétiques / moléculaires peuvent être vérifiées par la combinaison d’allèles pour chaque souche dans la même espèce

Service d’analyse des fragments

Le service d’analyse de fragments comprend divers services tels que le génotypage, le profilage ADN, la détection de mutations médicales et la recherche agricole.

Gene Life Sciences fournit un service d’analyse de microsatellites (VNTR) basé sur notre vaste expérience et expertise.

L’analyse de fragments est un service qui sépare et analyse les produits de PCR amplifiés selon des fragments à l’aide d’une amorce marquée par un marqueur fluorescent.

 

Types de services

  • Instabilité des microsatellites
  • Analyse du polymorphisme de longueur de fragment amplifié (AFLP)
  • Analyse du polymorphisme de longueur des fragments de restriction terminale (T-RFLP)
  • Quantification relative de la fluorescence – Perte d’hétérozygotie (LOH), tests d’aneuploïdie et détection de délétion chromosomique importante
  • Polymorphisme amplifié lié aux séquences (SRAP)

Fonctionnalités

  • Les données résultantes sont fournies sous forme de fichier FSA (des fichiers PDF et Excel sont également possibles)
  • Un service personnalisé de l’optimisation de la PCR à l’analyse des fragments est disponible

Séquençage personnalisé

Service d’optimisation / d’amplification PCR

L’optimisation de la PCR est un service personnalisé qui effectue et analyse l’ensemble du processus, de la conception de l’amorce à l’amplification par PCR, au séquençage et au rapport bio-informatique lorsque le client fournit des références avec la cellule / ADNg par rapport à la région cible souhaitée.

Si le taux de prétest est élevé en raison de la rareté de l’échantillon dans l’amplification PCR, l’amplification PCR nichée et l’amplification PCR FFPE, Gene Life Sciences résout le problème en utilisant son service d’amplification PCR personnalisé.

 

Fonctionnalités

  • Service personnalisé
  • Exécution de pré-tests pour fournir des résultats de haute qualité
  • L’ADNg peut être extrait d’échantillons de plantes et d’animaux

 

Location

DG-RSDT - El-Madania, Algiers.

(+213) 551972696

m.sellami@dgrsdt.dz

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